CRISPR-Cas9 是一種基因編輯技術(shù),它允許科學(xué)家們精確地修改 DNA。這個名字來源于"Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats",指的是細菌和古生菌基因組中一種獨特的 DNA 序列。Cas9 是一種酶,它能夠切割 DNA。CRISPR-Cas9 原本是細菌為了抵抗噬菌體進化出來的一種防御機制,但是由于起機制的破譯,現(xiàn)已成為了一種基因編輯的工具。且隨著研究的進一步深入,還發(fā)展出了先導(dǎo)編輯,單堿基編輯等更多更加精準(zhǔn)的編輯體系。

圖 1 CRISPR 系統(tǒng)是細菌/古菌的天然免疫防疫系統(tǒng)
CRISPR 發(fā)展歷程:

圖 2 Key Studies Characterizing and Engineering CRISPR Systems
CRISPR-Cas9 的工作原理:
CRISPR-Cas9 的工作原理可以分解為幾個關(guān)鍵部分:
- CRISPR 序列("指南針"): CRISPR 序列并非直接用于編輯,而是充當(dāng)了系統(tǒng)的"指南針"。在細菌的免疫系統(tǒng)中,這些序列是病毒 DNA 的片段,被細菌儲存起來,用于識別并對抗未來的病毒感染。
- 向?qū)?RNA (gRNA): 在基因編輯應(yīng)用中,科學(xué)家會人工合成一種叫做"向?qū)?RNA"(guide RNA,簡稱 gRNA)的分子。gRNA 由兩部分組成:
- CRISPR RNA (crRNA): 這部分序列是經(jīng)過設(shè)計的,與目標(biāo) DNA 序列的特定區(qū)域(通常是 20 個核苷酸)匹配。它就像一個精確的"地址標(biāo)簽",告訴 Cas9 酶要去 DNA 的哪個位置。
- 反式激活 CRISPR RNA (tracrRNA): 這部分 RNA 負責(zé)將 crRNA 招募到 Cas9 酶上,并穩(wěn)定 Cas9 酶的活性。在實際應(yīng)用中,crRNA 和 tracrRNA 通常被設(shè)計成一個單一的分子,即 gRNA。
- Cas9 酶("剪刀"): Cas9 是一種能夠切割 DNA 雙鏈的核酸酶。它本身并不知道要去哪里切割 DNA,它需要 gRNA 來引導(dǎo)。根據(jù)目前對 CRISPR--cas 系統(tǒng)的分類,CRISPR 系統(tǒng)已被分為六種不同類型(I--VI),每種類型都利用一組獨特的 Cas 蛋白以及 crRNA 來實現(xiàn) CRISPR 干擾。其中 I 型和 III 型系統(tǒng)利用大型多 Cas 蛋白復(fù)合物進行 crRNA 結(jié)合和靶序列降解,而 II 型 CRISPR 系統(tǒng)則采用單一的 DNA 核酸內(nèi)切酶 Cas9 來識別雙鏈 DNA 底物,并通過不同的核酸酶結(jié)構(gòu)域(HNH 或 RuvC)切割每條鏈。
圖 3 不同亞型代表性 Cas9 同源蛋白的結(jié)構(gòu)域組織示意圖。
- PAM 序列("定位標(biāo)記"): Cas9 酶在切割 DNA 時,還需要識別 DNA 序列中一個簡短的"原型間隔基相鄰基序"(Protospacer Adjacent Motif,簡稱 PAM)。PAM 序列通常是 NGG(N 可以是任何核苷酸)。PAM 序列的存在是 Cas9 酶能夠識別并結(jié)合到目標(biāo) DNA 位點的一個關(guān)鍵先決條件,它確保 Cas9 酶不會錯誤地切割細菌自身的 CRISPR 區(qū)域。

圖 4 CRISPR-Cas9 系統(tǒng)示意圖
工作流程:
- 結(jié)合: 人工合成的 gRNA 會與 Cas9 酶結(jié)合,形成一個復(fù)合物。
- 定位: 這個 Cas9-gRNA 復(fù)合物會在 DNA 中尋找與 gRNA 的 crRNA 部分匹配的序列。
- 識別 PAM: 一旦找到匹配的 DNA 序列,Cas9 還需要識別其附近的 PAM 序列。
- 切割: 當(dāng) gRNA 和 PAM 都被識別后,Cas9 酶就會在目標(biāo) DNA 位點執(zhí)行切割,產(chǎn)生一個 DNA 雙鏈斷裂(Double-Strand Break, DSB)。
DNA 的修復(fù)機制:
一旦 DNA 發(fā)生雙鏈斷裂,細胞自身就會啟動修復(fù)機制:
- 非同源末端連接 (NHEJ): 這是細胞中最常見的修復(fù)方式。它是一種"簡單粗暴"的修復(fù)方式,容易在斷裂處引入小片段的插入或刪除(indels),從而導(dǎo)致基因失活(基因敲除)。
- 同源定向修復(fù) (HDR): 如果在細胞中提供一個與斷裂位點同源的 DNA 模板,細胞就可以利用這個模板進行精確修復(fù)??茖W(xué)家可以利用這個機制,在斷裂處插入新的 DNA 序列,從而實現(xiàn)基因的精確修改(基因敲入)。

圖 5 . Double stranded break (DSB), endogenous DNA repair can occur by (A) non-homologous end joining (NHEJ) resulting in random indels, or by (B) homology-directed repair (HDR) which uses a template DNA strand for precise repair.
CRISPR-Cas9 的重要性和應(yīng)用:
CRISPR-Cas9 技術(shù)之所以如此重要,是因為它具有以下優(yōu)點:
- 精確性高: 能夠非常精確地靶向基因組中的特定位置。
- 操作簡便: 相較于之前的基因編輯技術(shù),CRISPR-Cas9 更易于設(shè)計和操作。
- 成本較低: 使得基因編輯技術(shù)更加普及。
- 高效性: 能夠相對高效地實現(xiàn)基因編輯。
這些優(yōu)勢使得 CRISPR-Cas9 在各個領(lǐng)域都展現(xiàn)出巨大的潛力:
- 基礎(chǔ)科學(xué)研究: 用于研究基因功能、構(gòu)建基因敲除/敲入模型。
- 疾病治療:
- 基因療法: 糾正導(dǎo)致遺傳性疾病的基因缺陷。
- 癌癥治療: 增強免疫細胞攻擊癌細胞的能力,或直接靶向癌細胞中的致病基因。
- 傳染病防治: 靶向病毒基因組,阻止病毒復(fù)制。
- 農(nóng)業(yè):
- 作物改良: 培育具有抗病、抗蟲、耐旱、高產(chǎn)等優(yōu)良性狀的作物。
- 畜牧業(yè): 培育更健康的動物,提高產(chǎn)量。
- 生物技術(shù): 用于合成生物學(xué)、開發(fā)新的生物材料等。

圖 6 Applications of Genome Engineering
在CRISPR-Cas9 實操中,構(gòu)建cas9 穩(wěn)轉(zhuǎn)株 或者共轉(zhuǎn)染cas9 和sgRNA是非常常見的手段。 cas9 蛋白是否能在靶細胞中表達是基因編輯是否成功的關(guān)鍵之一。因此需要通過WB 等方式來檢測cas9 可以說非常有必要的。 斯達特旗下Anti-Cas9 重組兔單抗,可用于CRISPR-Cas9 基因檢測,助力CRIPSR QC。
Cas9 Recombinant Mouse mAb (S-R500)(貨號:S0B1270)
驗證數(shù)據(jù):

WB result of Cas9 Recombinant Mouse mAb
Primary antibody: Cas9 Recombinant Mouse mAb at 1/2000 dilution
Lane 1: 293T transfected with empty vector whole cell lysate 5 µg
Lane 2: 293T transfected with Cas9-Myc-His fusion protein whole cell lysate
Secondary antibody: Goat Anti-mouse IgG, (H+L), HRP conjugated at 1/10000 dilution
Predicted MW: 150 kDa
Observed MW: 170 kDa
ICC shows positive staining in Cas9-Myc-His transfected 293T cells (top panel) and negative staining in vector-transfected 293T cells (below panel). Anti- Cas9 antibody was used at 1/500 dilution (Green) and incubated overnight at 4°C. Goat polyclonal Antibody to Mouse IgG - H&L (Alexa Fluor® 488) was used as secondary antibody at 1/1000 dilution. The cells were fixed with 4% PFA and permeabilized with 0.1% PBS-Triton X-100. Nuclei were counterstained with DAPI (Blue). Counterstain with tubulin (Red).
斯達特?zé)衢T抗體

杭州斯達特是優(yōu)寧維旗下品牌,志在為全球生命科學(xué)行業(yè)提供優(yōu)質(zhì)的抗體、蛋白、試劑盒等產(chǎn)品及研發(fā)服務(wù)。依托多個開發(fā)平臺:重組兔單抗、重組鼠單抗、快速鼠單抗、重組蛋白開發(fā)平臺(E.coli,CHO,HEK293,InsectCells)、一步法ELISA平臺,PTM泛修飾抗體平臺,已正式通過歐盟98/79/EC認證、ISO9001認證、ISO13485認證。
Cas9重組兔單抗,CRISPR 基因編輯檢測好幫手